陽子線治療施設
| 1 | 千葉県 | 国立がん研究センター東病院 |
| 2 | 兵庫県 | 兵庫県立粒子線医療センター |
| 3 | 静岡県 | 静岡県立静岡がんセンター |
| 4 | 茨城県 | 筑波大学附属病院 |
| 5 | 福島県 | 南東北がん陽子線治療センター |
| 6 | 鹿児島県 | メディポリス医学研究所 メディポリス国際陽子線治療センター |
| 7 | 福井県 | 福井県立病院 |
| 8 | 愛知県 | 名古屋市立大学医学部附属 西部医療センター |
| 9 | 北海道 | 北海道大学病院 |
| 10 | 長野県 | 社会医療法人財団慈泉会 相澤病院 |
| 11 | 岡山県 | 津山中央病院 |
| 12 | 北海道 | 社会医療法人禎心会 札幌禎心会病院 |
| 13 | 大阪府 | 医療法人伯鳳会 大阪陽子線クリニック |
| 14 | 兵庫県 | 兵庫県立粒子線医療センター附属神戸陽子線センター |
| 15 | 愛知県 | 成田記念陽子線センター |
| 16 | 奈良県 | 社会医療法人高清会 高井病院 |
| 17 | 京都府 | 京都府立医科大学附属病院 |
| 18 | 北海道 | 社会医療法人孝仁会 北海道大野記念病院 |
| 19 | 神奈川県 | 湘南鎌倉総合病院 |
| 20 | 岐阜県 | 中部国際医療センター（2024年3月診療開始） |
| 21 | 東京都 | 社会福祉法人仁生社江戸川病院（2025年秋：BNCT） |
| 22 | 東京都 | 令和5年度以降、都立駒込病院の敷地内などを候補に建設地や規模、事業手法などを考えて施設整備計画を立案予定（出所、未来の東京戦略 令和5年1月 P109） 2030年末頃～稼働 陽子線等治療施設整備事業の進捗状況 |
重粒子線治療施設
| 1 | 千葉県 | 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構 QST病院 |
| 2 | 兵庫県 | 兵庫県立粒子線医療センター |
| 3 | 群馬県 | 群馬大学医学部附属病院 |
| 4 | 佐賀県 | 九州国際重粒子線がん治療センター |
| 5 | 神奈川県 | 神奈川県立がんセンター |
| 6 | 大阪府 | 大阪重粒子線センター |
| 7 | 山形県 | 山形大学医学部東日本重粒子センター |
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